不存在治療腸炎最好的消炎藥。因為腸炎病因多樣，病情有別，適用藥物因人而異，需綜合考量後合理用藥。
感染性腸炎是常見類型。若是細菌感染引發，常用喹諾酮類抗生素，像諾氟沙星、左氧氟沙星等，抗菌譜廣，能有效抑制腸道常見病菌，對大腸桿菌、痢疾桿菌等引起的腸炎效果較好。但這類藥物18歲以下未成年人禁用，可能影響骨骼發育。還有頭孢類抗生素，如頭孢克肟，安全性高，副作用相對少，對多種細菌有強大殺菌作用，適合不能用喹諾酮類藥物的人群。
若是病毒感染導致的腸炎，通常無需使用消炎藥，因為消炎藥對病毒無效。一般通過對症治療和支持治療，如補充水分和電解質，防止脫水，多數患者可自愈。
寄生蟲感染引起的腸炎，要使用針對性的驅蟲藥物，如甲硝唑對阿米巴原蟲感染有效，吡喹酮可用於治療血吸蟲感染等。
非感染性腸炎，如潰瘍性結腸炎，屬於自身免疫性疾病，並非細菌等病原體感染，使用消炎藥不僅無效，還可能延誤病情。這類情況常用氨基水楊酸制劑、糖皮質激素、免疫抑制劑等藥物治療。
治療腸炎選擇消炎藥要謹慎。自行用藥可能掩蓋病情、延誤治療時機，還可能引發不良反應。出現腸炎症狀，如腹痛、腹瀉、發熱等，應及時就醫。醫生會通過詳細問診、糞便檢查、血常規等明確病因，再根據具體情況選擇合適藥物。
