肺奴卡菌病需要與肺結核、肺炎鏈球菌肺炎、肺曲霉菌病、肺隱球菌病、肺放線菌病等進行區別：
1.肺結核：肺奴卡菌病的症狀與肺結核有些相似，但肺結核常有低熱、盜汗、乏力等全身症狀，且結核菌素試驗多為陽性，而肺奴卡菌病的結核菌素試驗通常為陰性。
2.肺炎鏈球菌肺炎：肺炎鏈球菌肺炎起病急，高熱、寒戰、咳嗽、咳血痰等症狀較為突出，胸部X線檢查可見肺部實變影，而肺奴卡菌病的肺部影像表現多樣，可為結節、膿腫等。
3.肺曲霉菌病：肺曲霉菌病多發生在免疫力低下的人群中，常有咳嗽、咯血、胸痛等症狀，痰培養可發現曲霉菌，而肺奴卡菌病的痰培養結果為奴卡菌。
4.肺隱球菌病：肺隱球菌病的症狀較輕，可表現為咳嗽、咳痰、低熱等，影像學檢查可見肺部結節或腫塊，隱球菌莢膜多糖抗原檢測陽性，而肺奴卡菌病的相關檢測結果不同。
5.肺放線菌病：肺放線菌病與肺奴卡菌病在症狀上有一定相似性，但放線菌病患者的痰中可找到硫磺顆粒，這是與肺奴卡菌病的一個重要區別。
對於肺部疾病，應及時就醫，進行詳細的檢查和診斷，以便採取針對性的治療措施。在日常生活中，要注意增強免疫力，保持良好的生活習慣，如合理飲食、適量運動、充足睡眠等，有助於預防肺部疾病的發生。
