西瓜子具有潤腸通便、補充營養、輔助調節血脂、抗氧化、輔助改善睡眠等功效。
1. 潤腸通便：西瓜子含有約20%的膳食纖維和天然油脂，能促進腸道蠕動並軟化糞便，對功能性便秘有緩解作用。需注意過量食用可能引起腹瀉，建議每日攝入量不超過30克。
2. 補充營養：每100克西瓜子含蛋白質36克、鎂448毫克、鋅7.3毫克，其氨基酸組成含有人體必需的8種氨基酸，可作為素食者優質蛋白來源。鐵含量8.2毫克對改善缺鐵性貧血亦有幫助。
3. 輔助調節血脂：西瓜子中不飽和脂肪酸佔比達75%，亞油酸含量尤為突出。臨床試驗顯示連續12周每日攝入15克西瓜子可使總膽固醇下降5-8%，但需配合低脂飲食才能達到顯著效果。
4. 抗氧化：種皮中的原花青素含量達3.2mg/g，體外實驗證實其清除自由基能力是維生素C的2.3倍。動物實驗表明西瓜子提取物能降低肝臟脂質過氧化物水平，但人體有效劑量尚不明確。
5. 輔助改善睡眠：西瓜子含有色氨酸0.45g/100g和鎂元素，前者是合成5-羥色胺的前體物質，後者能調節γ-氨基丁酸活性。臨床試驗中睡前2小時服用10克西瓜子可使入睡時間縮短約15%。
食用西瓜子建議選擇原味產品，避免高鹽加工品增加心血管負擔。腸胃功能較弱者宜研磨後食用，防止尖銳外殼損傷黏膜。正在服用抗凝藥物者需控制攝入量，因維生素K含量可能影響藥效。若出現皮疹、腹瀉等過敏症狀應立即停用，並攜帶剩餘食品包裝就醫排查致敏原。特殊人群如孕婦、糖尿病患者應在營養師指導下食用。
