扁桃體發炎可通過以下幾個方面來判斷是細菌還是病毒感染：發熱程度及熱型、咽部症狀、全身症狀、血常規檢查、病程長短等。
發熱程度及熱型：細菌感染常引起高熱，體溫可達 39℃甚至更高，熱型多為稽留熱或弛張熱；病毒感染髮熱相對較低，多為低熱，熱型以不規則熱為主。
咽部症狀：細菌感染時咽部疼痛較劇烈，吞咽時加重，扁桃體紅腫明顯，表面可有膿點或膿苔；病毒感染時咽部疼痛相對較輕，扁桃體充血腫脹，但較少有膿點。
全身症狀：細菌感染全身症狀較重，可伴有畏寒、寒戰、乏力、肌肉酸痛等，兒童還可能出現驚厥；病毒感染全身症狀相對較輕，多為頭痛、鼻塞、流涕等。
血常規檢查：細菌感染時白細胞總數升高，中性粒細胞比例增高；病毒感染時白細胞總數可正常或偏低，淋巴細胞比例升高。
病程長短：細菌感染病程相對較短，一般在 3 - 5 天，若治療不及時或不徹底，易轉為慢性扁桃體炎；病毒感染病程較長，約 1 - 2 周，可自行緩解。
在判斷扁桃體發炎是細菌還是病毒感染時，不能僅憑某一項指標就下結論，需要綜合考慮多種因素。如果症狀持續不緩解或加重，應及時就醫，聽從醫生的建議進行進一步檢查和治療，以避免病情延誤。
