化膿性甲溝炎的治療方法主要有藥物治療、物理治療、切開引流、拔甲治療、甲溝重建術等。
1. 藥物治療：對於化膿性甲溝炎，藥物治療是常見的基礎方法。外用藥物如莫匹羅星軟膏，它能有效抑制和殺滅多種革蘭陽性球菌，對引起甲溝炎的常見病菌有很好的抗菌作用，可直接塗抹在患處，減輕炎症。夫西地酸乳膏也常用於此疾病，其能通過抑制細菌蛋白質的合成來發揮抗菌活性，有助於控制局部感染。口服藥物如阿莫西林膠囊，它屬於β-內酰胺類抗生素，能抑制細菌細胞壁的合成，從而達到殺菌效果，遵醫囑服用可從體內對抗感染病菌。
2. 物理治療：物理治療對化膿性甲溝炎也有一定效果。熱敷可促進局部血液循環，加快炎症的消散和吸收，使局部的紅腫疼痛症狀得到緩解。超短波治療利用高頻電磁波作用於患處，能改善局部組織的營養代謝，增強白細胞的吞噬功能，有助於減輕炎症反應，促進傷口愈合。紅外線照射則通過溫熱效應，使局部血管擴張，增加局部的血液供應，提高機體的抵抗力，利於炎症的消退。
3. 切開引流：當化膿性甲溝炎局部膿腫形成時，切開引流是必要的手段。因為膿腫積聚在甲溝部位，會導致局部壓力升高，加重疼痛和炎症，且不利於藥物發揮作用。通過切開膿腫，將膿液排出，降低局部壓力，減輕炎症對周圍組織的壓迫，同時也能讓抗菌藥物更好地到達感染部位，從而有效控制感染，促進病情恢復。一般在局部麻醉下，於膿腫波動最明顯處切開，引出膿液。
4. 拔甲治療：對於病情較為嚴重，指甲下積膿較多，或指甲與甲床分離的化膿性甲溝炎患者，常採用拔甲治療。指甲下積膿會持續刺激甲溝及周圍組織，不拔除指甲，感染很難徹底清除。拔除指甲後，能充分暴露感染創面，便於進行徹底的清創和引流，使藥物能更好地作用於患處，促進新生指甲的生長，從根本上解決感染問題。在局部麻醉下，將患甲完整拔除。
5. 甲溝重建術：這是針對一些慢性化膿性甲溝炎，經保守治療效果不佳，且甲溝結構已被破壞的情況。由於長期的炎症刺激，甲溝的正常結構和功能受損，單純的藥物或引流等方法難以恢復。甲溝重建術通過手術重新塑造甲溝的形態和結構，恢復其正常的生理功能，減少細菌滋生和感染的機會，從而達到徹底治癒化膿性甲溝炎的目的。手術需精細操作，重建甲溝的皮膚、甲床等組織。
治療期間要嚴格按照醫生的安排用藥、進行治療操作。保持患處清潔乾燥，避免沾水，防止再次感染。飲食上盡量避免食用辛辣、刺激性食物，以免加重炎症反應。按照醫生要求定期換藥和復查，以便及時瞭解病情的恢復情況，根據恢復狀況調整治療方案。
