3個月嬰兒老是便秘可能是飲食結構不合理、腸道功能不完善、腸道菌群失調、先天性巨結腸、肛門直腸發育異常等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有調整飲食、腹部按摩、補充益生菌、手術治療等。
1. 飲食結構不合理：3個月嬰兒若為母乳餵養，媽媽飲食過於油膩、辛辣，可能影響寶寶消化；若為奶粉餵養，奶粉衝調過稠，也易導致便秘。媽媽應調整自身飲食，多吃蔬菜、水果、清淡飲食；奶粉餵養要按正確比例衝調奶粉，兩餐之間適當餵點溫水。
2. 腸道功能不完善：3個月嬰兒腸道功能尚未發育成熟，蠕動相對緩慢，易出現便秘。可每天給寶寶進行腹部按摩，以肚臍為中心，順時針輕柔按摩，每次10 - 15分鐘，每天2 - 3次，促進腸道蠕動。
3. 腸道菌群失調：使用抗生素、腹部著涼等可能破壞腸道菌群平衡，引發便秘。可遵醫囑服用雙歧桿菌三聯活菌散、枯草桿菌二聯活菌顆粒、地衣芽孢桿菌活菌膠囊，調節腸道菌群，改善便秘情況。
4. 先天性巨結腸：是一種腸道發育畸形，腸壁神經節細胞缺如，導致腸管持續痙攣，糞便淤滯於近端結腸，使該段腸管肥厚、擴張。確診後一般需手術治療，切除病變腸段。
5. 肛門直腸發育異常：如肛門狹窄等，會導致排便困難。需就醫檢查，根據具體情況，可能需要進行擴肛等治療，嚴重時可能需手術處理。
日常要密切觀察寶寶的排便情況、精神狀態、食慾等。若便秘持續不緩解或伴有腹脹、嘔吐、哭鬧不止等異常表現，應及時就醫，在醫生指導下進行進一步檢查和治療。
