肛周膿腫可通過中藥內服、中藥坐浴、中藥外敷、中藥灌腸、手術治療等進行治療。
1. 中藥內服：對於肛周膿腫患者，可使用仙方活命飲加減，其由金銀花、防風、白芷等多味藥材組成，具有清熱解毒、消腫潰堅、活血止痛的功效，能從內部調節身體機能，清除體內熱毒，緩解肛周膿腫引發的紅腫熱痛等症狀。還有黃連解毒湯，以黃連、黃芩、黃柏、梔子為主要成分，可瀉火解毒，減輕炎症反應。以及透膿散，能托毒潰膿，促使膿腫破潰排出，加快病情好轉。這些方劑需由專業中醫師根據患者具體情況辨證論治後開具，按要求服用。
2. 中藥坐浴：選用苦參湯，苦參、蛇床子、黃柏等藥材，加水煎製成湯液，趁熱先熏後坐浴。熱氣熏蒸可使局部血管擴張，促進血液循環，藥物成分通過皮膚滲透吸收，能起到清熱燥濕、殺蟲止癢、消腫止痛的作用，對於肛周膿腫局部的炎症有很好的緩解效果，減輕患者的不適症狀。每天坐浴1 - 2次，每次15 - 20分鐘。
3. 中藥外敷：如意金黃散，主要成分有姜黃、大黃、黃柏等，用醋或蜂蜜調成糊狀，外敷於肛周膿腫部位。其具有清熱解毒、消腫止痛的功效，能直接作用於病變局部，減輕紅腫熱痛，促進炎症消散。還有龍珠軟膏，含有人工麝香、硼砂等成分，可清熱解毒、消腫止痛、祛腐生肌，對肛周膿腫破潰後的創面愈合有一定幫助。將藥物均勻塗抹於患處，每日換藥1 - 2次。
4. 中藥灌腸：採用大承氣湯保留灌腸，大黃、厚朴、枳實、芒硝等藥材煎成藥液，通過灌腸的方式使藥物直達病所。可通腑瀉熱，清除腸道內的積滯和熱毒，減少熱毒對肛周組織的侵襲，從而緩解肛周膿腫的症狀。灌腸時需注意藥液溫度適中，操作輕柔，避免損傷腸道。
5. 手術治療：當肛周膿腫病情嚴重，通過保守治療效果不佳時，需進行手術切開引流。手術能直接將膿腫內的膿液排出，清除感染病灶，防止炎症進一步擴散。術後配合中藥坐浴、換藥等治療，促進傷口愈合。
治療期間要注意保持肛周清潔，勤換內褲，避免久坐，飲食上避免食用辛辣、油膩、刺激性食物，以清淡易消化為主，保證大便通暢，避免用力排便加重病情，同時要嚴格按照醫生的安排進行治療和復診。
