通常牛磺酸飲料偶爾喝一次不會對身體產生過大危害，但經常或大量喝，有可能對腎臟、心血管、腦神經等產生一定危害。
1.腎臟：飲料須經腎臟的轉化和代謝後才能被排出體外，腎臟功能異常的人群大量飲用後可增加代謝負擔，會對腎臟造成一定損傷。
2.心血管：牛磺酸飲料中的牛磺酸在刺激神經興奮後，也會導致血液流速加快，所以日常大量喝，更容易加重對大腦和心臟供血的刺激，尤其是本身患有心肌炎、冠狀動脈粥樣硬化性心臟病的人群更易產生心悸、胸痛等症狀。
3.腦神經：牛磺酸會刺激大腦神經，引起中樞神經興奮，所以短期內大量喝牛磺酸飲料，可能導致人出現興奮、激動、精力充沛等表現，而且長期喝容易引發睡眠質量下降、失眠、多夢等問題發生。
日常生活中不建議長期或大量喝牛磺酸飲料，如經檢查發現體內缺乏牛磺酸時，可在醫生指導下服用藥物治療，不建議通過喝牛磺酸飲料補充。
