先天性虹膜缺損一般不能治療，不過可採取一些措施緩解病情引發的症狀。
先天性虹膜缺損是人體在發育過程中虹膜產生異常引起，一旦出現後人體自身無法對缺損部位進行修復，受病情影響虹膜調節功能發生異常，會出現畏光、視物重影等症狀。這種情況屬於先天性疾病，並且目前的醫學技術無法對缺損的虹膜進行修復，因此，此種疾病是無法進行治療的。
先天性虹膜缺損患者日常生活中視力發生障礙可通過佩戴虹膜隱形眼鏡緩解眼睛的不適，同時對病情進行矯正。日常生活中也要注意做好眼部護理，避免長時間熬夜或是用眼，防止眼疲勞的發生。如果同時伴有其他疾病比如白內障、晶狀體病變，這些疾病可通過手術治療進行改善。
先天性虹膜缺損還是一種常染色遺傳性疾病，雖然沒有特別好的治療方法，但是通過矯正後可達到正常視力。
