長時間低頭工作頸椎痛可能是姿勢不良、頸部肌肉勞損、頸椎小關節紊亂、頸椎骨質增生、頸部外傷等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有改善姿勢、物理治療、康復訓練等。
1. 姿勢不良：長時間低頭工作會使頸椎處於過度前屈的不良姿勢，導致頸椎生理曲度變直，椎間隙壓力改變，周圍肌肉、韌帶等軟組織長時間處於緊張狀態，從而引發頸椎疼痛。日常應保持正確坐姿，電腦屏幕與眼睛平視，避免長時間低頭，定時起身活動頸部，進行簡單的伸展運動，如頸部前屈、後伸、左右側屈及旋轉等，緩解肌肉緊張。
2. 頸部肌肉勞損：持續低頭工作使頸部肌肉長時間承受較大壓力，不斷收縮，容易引起肌肉疲勞、損傷，產生無菌性炎症，刺激神經導致疼痛。可通過熱敷，用熱毛巾或熱水袋敷於頸部疼痛部位，每次 15 - 20 分鐘，每天 3 - 4 次，促進血液循環，緩解疼痛；也可進行按摩，由專業人員按摩頸部肌肉，放鬆緊張肌肉；還可遵醫囑外用雙氯芬酸二乙胺乳膠劑、雲南白藥膏、氟比洛芬巴布膏等藥物減輕炎症和疼痛。
3. 頸椎小關節紊亂：長時間低頭工作可能導致頸椎小關節發生微小錯位，引起關節滑膜嵌頓或關節囊損傷，刺激周圍神經和血管，引發疼痛。可前往醫院由專業醫生進行手法復位，調整頸椎小關節位置，解除滑膜嵌頓和關節囊損傷；配合紅外線照射，改善局部血液循環，促進損傷修復；同時遵醫囑口服布洛芬緩釋膠囊、塞來昔布膠囊、依託考昔片等藥物消炎止痛。
4. 頸椎骨質增生：長期低頭工作使頸椎長期處於異常應力狀態，刺激椎體邊緣骨質增生，增生的骨質可能壓迫周圍神經、血管等組織，導致頸椎疼痛。可進行頸椎牽引，借助器械拉開椎間隙，減輕增生骨質對周圍組織的壓迫；進行針灸治療，刺激頸部穴位，疏通經絡，緩解疼痛；遵醫囑服用抗骨增生片、藤黃健骨丸、仙靈骨葆膠囊等藥物，延緩骨質增生發展，減輕症狀。
5. 頸部外傷：若之前頸部有過輕微外傷，在長時間低頭工作時，受傷部位受到進一步牽拉、刺激，可能引發疼痛。受傷早期可進行冷敷，收縮血管，減輕腫脹疼痛；後期熱敷促進淤血吸收；疼痛明顯時遵醫囑服用三七傷藥片、跌打丸、愈傷靈膠囊等藥物，促進損傷修復。
日常要注意保持良好的頸部姿勢，避免頸部過度勞累，適當進行頸部鍛鍊，如游泳、放風箏等。若頸椎痛症狀持續不緩解或加重，應及時就醫，明確病因，在醫生指導下規範治療 。
