陰莖長小硬包可能是珍珠狀陰莖丘疹、皮脂腺異位症、毛囊炎、尖銳濕疣、陰莖硬結症等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有局部用藥、物理治療、手術治療等。
1. 珍珠狀陰莖丘疹：這是常見生理變異，多位於陰莖冠狀溝邊緣，呈針尖至針頭大小半透明小硬包，排列整齊無自覺症狀，無需特殊治療，若因美觀需求可遵醫囑用藥如維A酸乳膏、咪喹莫特乳膏，或採用激光治療。
2. 皮脂腺異位症：因皮脂腺發育異常或增生所致，常見於陰莖皮膚，表現為針頭大小淡黃色或淡白色小硬包，無不適症狀，一般無需治療，若影響外觀可遵醫囑用藥如他克莫司軟膏，或選擇冷凍治療。
3. 毛囊炎：由細菌感染毛囊引起，表現為紅色丘疹頂端可現膿皰，質地偏硬伴疼痛或瘙癢，需遵醫囑用藥如莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏、頭孢呋辛酯片，注意保持局部清潔。
4. 尖銳濕疣：由人乳頭瘤病毒感染引起的性傳播疾病，表現為菜花狀、乳頭狀小硬包可逐漸增大增多，需遵醫囑用藥如鬼臼毒素酊、咪喹莫特乳膏、干擾素凝膠，或採用激光、冷凍等物理治療。
5. 陰莖硬結症：因陰莖海綿體白膜纖維化所致，表現為陰莖背側或外側硬結節或斑塊，勃起時可現疼痛或彎曲，早期可遵醫囑用藥如維生素E軟膠囊、秋水仙鹼片、他莫昔芬片，嚴重者需手術治療。
日常需保持陰莖部位清潔乾燥，避免過度摩擦及不潔性行為，若小硬包伴隨疼痛、瘙癢、增大等異常情況，應及時就醫明確診斷，切勿自行用藥以免延誤病情，治療期間需遵循醫囑完成療程，定期復查評估恢復情況。
