一般情況下，胃鏡腸鏡一起做所需時間通常在30分鐘到60分鐘。
做胃鏡時，醫生需將胃鏡經口腔插入食管、胃及十二指腸，仔細觀察這些部位的黏膜情況，查看是否存在病變，如潰瘍、息肉、腫瘤等。做腸鏡則是把腸鏡從肛門插入，經過直腸、結腸等部位，同樣進行細緻的觀察。由於這兩個檢查都需要一定時間來完成操作和觀察，所以整體時間會在上述區間。
如果患者的消化道情況比較良好，沒有複雜的病變，醫生操作熟練，整個檢查過程可能相對順利，時間會接近30分鐘。但要是患者存在一些特殊情況，比如腸道準備不充分，影響觀察視野，或者在檢查過程中發現了較多問題，像胃內有多處可疑病變需要取組織做病理檢查，腸道內有較大息肉需要切除等，就會增加操作的難度和時間，可能會接近60分鐘甚至更久。
檢查結束後，要注意休息，避免劇烈運動。短時間內飲食應以清淡、易消化為主，避免食用辛辣、油膩、刺激性食物。如果檢查過程中有取組織做病理檢查或進行了一些治療操作，需嚴格按照醫生的囑咐進行後續護理和復診，若出現腹痛、便血等異常情況，應及時就醫。
