鈎端螺旋體病的併發症有眼後發症、神經系統後發症、反應性腦膜炎、閉塞性腦動脈炎、心肌損害等。
1. 眼後發症：多發生於退熱後1周~1個月，以葡萄膜炎、虹膜睫狀體炎最為常見，脈絡膜炎、視網膜炎等也可出現，嚴重者可影響視力。
2. 神經系統後發症：在急性期熱退後數周至數月出現，可表現為無菌性腦膜炎、腦脊髓炎等，患者可能出現頭痛、嘔吐、頸項強直、肢體癱瘓等症狀。
3. 反應性腦膜炎：一般在鈎端螺旋體病急性期後，因機體對病原體產生免疫反應，累及腦膜引發，症狀相對較輕，有頭痛、發熱、腦膜刺激徵等表現。
4. 閉塞性腦動脈炎：較為少見，多在病後半個月到5個月出現，是由於腦動脈內膜炎導致管腔狹窄或閉塞，引起腦實質缺血、梗死，患者可出現偏癱、失語、多次反復短暫性肢體癱瘓等症狀。
5. 心肌損害：可出現心肌酶升高、心電圖異常等表現，嚴重時可導致心律失常、心力衰竭等，影響心臟功能。
鈎端螺旋體病患者康復後也需關注身體狀況，定期復查。日常要注意個人衛生，避免接觸可能被污染的水源、土壤等。若從事易接觸鈎端螺旋體的職業，如農民、獸醫等，應做好防護措施。一旦出現不適症狀，需及時就醫，遵循醫生的診斷和治療建議，防止併發症的發生和發展。
