巧克力囊腫通常會導致痛經。巧克力囊腫是子宮內膜異位到卵巢形成的，隨著月經週期，異位內膜也會出血，使囊腫內壓力增加，刺激周圍組織，引發疼痛。疼痛程度因人而異，有的患者痛經症狀較輕，有的則較為嚴重。
巧克力囊腫引發的痛經多為進行性加重，在月經來潮前1 - 2天開始，經期第1天最劇烈，以後逐漸減輕，可持續整個經期。除了痛經，還可能伴有性交痛、不孕等情況。性交時囊腫受到碰撞、擠壓，會引起疼痛；而囊腫影響卵巢功能、盆腔微環境等，導致受孕困難。
巧克力囊腫的診斷一般依靠超聲檢查、腹腔鏡檢查等。超聲能清晰看到囊腫的大小、位置等情況；腹腔鏡檢查則可以直接觀察盆腔內的病變情況，還能取組織進行病理檢查明確診斷。
對於巧克力囊腫患者，日常要注意經期衛生，避免劇烈運動和性生活，防止經血逆流。注意保暖，尤其是腹部，可適當熱敷緩解疼痛。保持良好的心態，避免精神緊張和焦慮。定期復查，瞭解囊腫的變化情況。若出現症狀加重等異常，應及時就醫，嚴格按照醫生的建議進行治療。
