基底動脈閉塞腦幹梗死可能是動脈粥樣硬化、血栓形成、栓塞、血管痙攣、先天性血管畸形等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有藥物治療、介入治療、手術治療等。
1.動脈粥樣硬化：是最常見的病因。長期高血壓、高血脂、糖尿病、吸煙等是其危險因素。可遵醫囑服用阿托伐他汀鈣片、阿司匹林腸溶片、硫酸氫氯吡格雷片等藥物，以穩定斑塊、抗血小板聚集。
2.血栓形成：血液黏稠度增加、血流緩慢等可能導致血栓形成。可通過改善生活方式，如適量運動、多喝水等，以及遵醫囑使用低分子肝素鈉注射液、華法林鈉片、利伐沙班片等藥物進行抗凝治療。
3.栓塞：心源性栓塞如心房顫動、心臟瓣膜病等，或其他部位的栓子脫落，可能堵塞基底動脈。治療需針對原發病，如控制心律失常，同時遵醫囑使用溶栓藥物如阿替普酶注射液、尿激酶注射液等。
4.血管痙攣：情緒激動、寒冷刺激、某些藥物等可能引起血管痙攣。應避免誘因，保持情緒穩定，注意保暖。必要時遵醫囑使用尼莫地平片、鹽酸法舒地爾注射液、地爾硫䓬膠囊等緩解血管痙攣。
5.先天性血管畸形：較為罕見，是由於胚胎發育過程中血管發育異常所致。可通過血管造影等檢查明確診斷，根據具體情況選擇介入治療或手術治療。
對於基底動脈閉塞腦幹梗死的患者，在治療的同時，還應注意保持健康的生活方式，如合理飲食、適量運動、戒煙限酒等。定期進行復查，以便及時發現問題並進行處理。
