慢性腸胃炎需要與消化性潰瘍、胃腸功能紊亂、腸道寄生蟲感染、腸結核、克羅恩病等相鑒別。
1. 消化性潰瘍：主要指發生於胃和十二指腸的慢性潰瘍，具有週期性、節律性上腹部疼痛的特點。胃潰瘍疼痛多在餐後半小時至1小時出現，持續1 - 2小時後逐漸緩解；十二指腸潰瘍疼痛多在空腹時發作，進食後緩解，疼痛還會在夜間發作。通過胃鏡檢查可明確診斷，胃鏡下可見潰瘍面。
2. 胃腸功能紊亂：通常與精神因素、飲食不規律等有關。患者會出現胃腸道症狀，如腹痛、腹脹、腹瀉、便秘等，但各項檢查往往無明顯器質性病變。症狀常反復出現，時輕時重，可受情緒、應激等因素影響。
3. 腸道寄生蟲感染：常見的有蛔蟲、縧蟲、鈎蟲等感染。患者可能有腹痛、腹瀉、消瘦等症狀，部分患者還可能在糞便中發現蟲體。通過糞便檢查查找蟲卵可輔助診斷。
4. 腸結核：多由人型結核分枝桿菌引起，常見症狀有腹痛、腹瀉與便秘交替、低熱、盜汗、乏力等全身症狀。患者多有肺結核病史，結核菌素試驗、結腸鏡檢查及病理活檢有助於診斷。
5. 克羅恩病：是一種病因不明的腸道炎症性疾病，可累及全消化道。臨床表現多樣，包括腹痛、腹瀉、腹部腫塊、瘻管形成等，病情呈慢性、反復發作。結腸鏡檢查及病理活檢對診斷有重要意義。
對於出現胃腸道不適症狀的患者，應及時就醫，詳細描述症狀特點及病史，配合相關檢查，以便明確診斷並進行針對性治療。
