雙歧桿菌三聯活菌腸溶膠囊的副作用有胃腸道不適、過敏反應、皮疹、瘙癢、口腔異味等。
1. 胃腸道不適：部分人服用雙歧桿菌三聯活菌腸溶膠囊後，可能會出現胃腸道不適症狀，比如輕微的腹痛、腹脹，因為腸道菌群在調整過程中，對腸道產生一定刺激，一般這種不適症狀較為短暫，隨著身體對藥物的適應會逐漸減輕。
2. 過敏反應：少數過敏體質人群，可能會對雙歧桿菌三聯活菌腸溶膠囊中的某些成分產生過敏反應，表現為呼吸急促、皮膚發紅等症狀，一旦出現過敏症狀，應立即停止用藥，並及時就醫。
3. 皮疹：個別患者在用藥後可能會出現皮疹，多表現為皮膚表面出現紅色的小疹子，可能伴有輕微的瘙癢感，皮疹的出現可能與身體對藥物成分的特殊反應有關。
4. 瘙癢：除了皮疹可能伴隨瘙癢外，也有患者單獨出現皮膚瘙癢的情況，瘙癢程度因人而異，嚴重時可能影響患者的日常生活和睡眠質量。
5. 口腔異味：極個別患者在服用雙歧桿菌三聯活菌腸溶膠囊後，會出現口腔異味的現象，這可能是藥物在體內代謝過程中，影響了口腔內的微生物平衡導致的。
在使用雙歧桿菌三聯活菌腸溶膠囊時，要嚴格按照醫生的囑咐用藥，不要自行增減劑量。用藥期間要留意自身身體狀況，若出現上述副作用或其他異常情況，應及時與醫生溝通。同時，要注意藥物的保存條件，確保藥物的活性和療效。
