不存在肥厚梗阻心肌病絕對最新的治療辦法，醫學是不斷發展進步的，新的治療手段和藥物持續湧現，但每種治療方式都有其適用情況和局限性。
藥物治療是基礎。β受體阻滯劑能減慢心率、降低心肌收縮力，減輕流出道梗阻，緩解症狀，改善患者生活質量。非二氫吡啶類鈣通道阻滯劑也有類似作用，可鬆弛心肌，減輕梗阻。當藥物治療效果不佳時，可考慮非藥物治療手段。
室間隔切除術是經典的治療方式。通過切除部分肥厚的室間隔心肌，解除流出道梗阻，顯著改善患者症狀和心臟功能，是治療肥厚梗阻心肌病的有效方法，但手術有一定風險，需要嚴格評估患者身體狀況。
酒精室間隔消融術是一種相對微創的介入治療手段。通過向供應室間隔肥厚心肌的血管注入無水酒精，造成局部心肌梗死，使肥厚心肌變薄，從而減輕流出道梗阻。該方法創傷小、恢復快，但可能存在一些併發症，如房室傳導阻滯等。
對於病情嚴重、藥物及其他治療效果差的患者，心臟移植是最後的選擇。不過心臟供體有限，且術後需要長期服用免疫抑制劑，面臨感染等諸多問題。
治療肥厚梗阻心肌病需要綜合考慮患者的症狀、心臟結構和功能、基因檢測結果等多方面因素，制定個體化的治療方案。患者應積極配合醫生，定期復查，根據病情變化及時調整治療策略。日常生活中保持健康的生活方式，避免劇烈運動、情緒激動等，以維持病情穩定，提高生活質量。
