不存在治療膝蓋疼效果最好的藥。膝蓋疼原因多樣，用藥需根據具體病因和個體差異選擇，以下是常見情況及用藥建議。
若是外傷導致膝蓋疼，在損傷初期，可使用雲南白藥氣霧劑，能活血散瘀、消腫止痛，緩解因跌打損傷引起的疼痛與腫脹。若疼痛較為嚴重，可口服非甾體抗炎藥，如布洛芬，減輕炎症和疼痛。
對於骨關節炎引發的膝蓋疼，硫酸氨基葡萄糖或鹽酸氨基葡萄糖是常用藥物，它們能促進軟骨修復和再生，減緩關節軟骨磨損。疼痛明顯時，可外用雙氯芬酸二乙胺乳膠劑，通過皮膚滲透，直達患處，減輕疼痛和炎症。
類風濕關節炎累及膝蓋，除了使用非甾體抗炎藥控制疼痛外，還需使用抗風濕藥物，如甲氨蝶呤、來氟米特等，從根本上控制病情進展，防止關節畸形。
痛風性關節炎致使膝蓋疼，在急性發作期，秋水仙鹼可快速緩解疼痛和炎症。非甾體抗炎藥同樣適用，嚴重時可能需使用糖皮質激素。病情緩解後，需服用降尿酸藥物，如別嘌醇、非布司他等，減少尿酸生成，預防痛風再次發作。
膝蓋疼用藥要謹慎。自行用藥前，應先明確病因。用藥過程中，若症狀未緩解甚至加重，或出現不良反應，要及時就醫。同時，用藥期間要注意休息，避免過度活動加重膝蓋負擔，影響恢復。
