科根綜合徵的發生可能是感染、自身免疫異常、遺傳、外傷、環境因素等，需要針對病因治療，可採取的方法有抗感染、調節免疫、基因治療、修復損傷、改善環境等。
1. 感染：細菌、病毒等病原體感染可能誘發科根綜合徵。一些常見病原體如肺炎鏈球菌、流感病毒等入侵人體後，引發免疫反應，可能累及眼部和內耳等器官。對於細菌感染，可遵醫囑使用阿莫西林膠囊、頭孢克肟分散片、阿奇霉素顆粒進行抗感染治療；病毒感染則可遵醫囑選用阿昔洛韋片、利巴韋林顆粒、更昔洛韋膠囊抑制病毒複製。
2. 自身免疫異常：機體免疫系統錯誤地攻擊自身組織，導致眼部和內耳等部位受損。免疫系統紊亂可能與多種因素有關。通常會遵醫囑使用糖皮質激素如潑尼松片、甲潑尼龍片來抑制免疫反應；還可能使用免疫抑制劑如環磷酰胺膠囊、硫唑嘌呤片，來調節異常的免疫狀態。
3. 遺傳：部分患者存在相關基因缺陷，遺傳因素使得他們更容易患上科根綜合徵。目前針對遺傳因素，基因治療是研究方向之一，但尚未廣泛應用。一些對症治療藥物如改善內耳循環的銀杏葉提取物片、甲鈷胺片、倍他司汀片，可在醫生指導下使用以緩解症狀。
4. 外傷：頭部或耳部受到嚴重撞擊等外傷，可能破壞內耳結構，引發免疫反應，進而導致科根綜合徵。對於外傷引起的情況，需及時處理傷口，預防感染。可遵醫囑使用雲南白藥膠囊促進傷口愈合，三七片活血化瘀，頭孢拉定膠囊預防感染。
5. 環境因素：長期暴露在噪音、化學物質污染等不良環境中，可能損傷內耳和眼部組織，誘發疾病。應盡量避免不良環境，可遵醫囑使用營養神經藥物如維生素B1片、維生素B12片、谷維素片，改善內耳和眼部的營養供應。
治療期間要嚴格按照醫生要求用藥，不可自行增減藥量或停藥。定期到醫院復查，包括聽力、視力等相關檢查，以便及時調整治療方案。保持健康的生活方式，均衡飲食，適度運動，避免勞累，有助於身體恢復。
