肺部疾病、中耳疾病、心血管疾病、精神疾病、未控制的感染等可能是高壓氧治療的禁忌因素，需要針對病因治療，可採取的方法有藥物治療、手術治療等。
1. 肺部疾病：如氣胸、肺大皰等。肺部存在這些病變時，高壓氧環境可能導致氣體膨脹，加重氣胸或引起肺大皰破裂。對於氣胸，少量氣胸可採取保守觀察，讓氣體自行吸收；中大量氣胸常需進行胸腔閉式引流術排出氣體。肺大皰患者，若肺大皰較小且無症狀，可定期復查觀察；若肺大皰較大或反復引起症狀，可能需手術切除肺大皰。
2. 中耳疾病：像鼓膜穿孔、急性中耳炎等。在高壓氧治療過程中，中耳內外壓力不平衡，會加重耳部不適甚至損傷。鼓膜穿孔患者，小的穿孔可使用氧氟沙星滴耳液、硼酸冰片滴耳液、鹽酸洛美沙星滴耳液均需遵醫囑用藥預防感染，促進愈合；較大穿孔或長期不愈合的穿孔可能需手術修補。急性中耳炎患者，可使用頭孢克肟顆粒、阿莫西林膠囊、阿奇霉素片均遵醫囑用藥控制炎症，待炎症消退後再評估是否適合高壓氧治療。
3. 心血管疾病：例如未控制的高血壓、嚴重冠心病等。高壓氧治療可能引起血壓波動、心臟負荷改變。未控制的高血壓患者，需規律服用硝苯地平緩釋片、氨氯地平片、厄貝沙坦膠囊均遵醫囑用藥控制血壓，待血壓平穩後再考慮。嚴重冠心病患者，若存在心肌缺血、心律失常等，需先進行規範的藥物治療或必要的介入治療改善心臟功能。
4. 精神疾病：如癲癇、精神分裂症等。高壓氧環境可能誘發癲癇發作或加重精神症狀。癲癇患者，需規律服用丙戊酸鈉片、卡馬西平片、苯妥英鈉片均遵醫囑用藥控制癲癇發作，病情穩定後再評估。精神分裂症患者，需使用奧氮平片、利培酮膠囊、喹硫平片均遵醫囑用藥控制精神症狀，病情緩解後決定是否能進行高壓氧治療。
5. 未控制的感染：如敗血症、嚴重呼吸道感染等。此時進行高壓氧治療可能導致感染擴散。對於敗血症患者，需根據病原菌選用敏感抗生素，如注射用頭孢曲松鈉、注射用美羅培南、注射用萬古霉素均遵醫囑用藥控制感染。嚴重呼吸道感染患者，可使用阿奇霉素分散片、阿莫西林克拉維酸鉀片、鹽酸左氧氟沙星膠囊均遵醫囑用藥抗感染，待感染控制後再考慮高壓氧治療。
治療前應如實告知醫生自身病史、疾病情況等，配合醫生進行全面評估。治療過程中若出現不適，及時向醫護人員反饋。治療後按要求進行復查，以便醫生瞭解治療效果並調整後續方案。
