咳嗽大部分情況下屬於呼吸系統疾病，但也可能不屬於。如果是由呼吸道感染、哮喘等引起的，一般屬於呼吸系統疾病；但如果是由胃食管反流、藥物副作用等非呼吸系統原因導致的，通常不屬於。
咳嗽是呼吸系統最常見的症狀之一，像上呼吸道感染、流行性感冒等呼吸道感染，炎症會刺激呼吸道黏膜，使呼吸道產生過多分泌物，刺激咳嗽感受器，引發咳嗽反射，將分泌物排出體外。還有哮喘，由於氣道的慢性炎症和高反應性，遇到過敏原等刺激時，氣道會痙攣、收縮，也會導致咳嗽。這些疾病主要是呼吸系統本身出現問題而引起咳嗽。
咳嗽也可能是其他系統疾病導致的，例如胃食管反流，胃酸反流至食管，刺激食管黏膜，食管和氣管相鄰，刺激可能會傳導至氣管，引起咳嗽。另外，某些藥物的副作用也可能引發咳嗽，如血管緊張素轉換酶抑制劑，會使緩激肽等物質在體內堆積，刺激呼吸道，產生咳嗽，在此情況下一般不屬於呼吸系統疾病。
如果咳嗽持續時間較長，如超過兩周，或者伴有發熱、咳痰帶血、呼吸困難等症狀，應及時就醫以便準確診斷，並進行針對性的治療。
