通常情況下，支原體感染引起的咳嗽是可以治癒的。
支原體感染人體後，會黏附在呼吸道或泌尿生殖道等部位的上皮細胞表面，引發免疫反應，從而導致咳嗽等一系列症狀。當針對支原體感染進行有效治療時，常用的治療方法是使用抗生素，比如大環內酯類抗生素如阿奇霉素、紅霉素等，這些藥物能夠抑制支原體蛋白質的合成，從而抑制支原體的生長、繁殖，逐步清除體內的支原體。隨著支原體被清除，呼吸道的炎症會逐漸減輕，受損的呼吸道黏膜等組織會逐漸修復，咳嗽症狀也會隨之緩解直至消失。
在大多數情況下，患者只要及時就醫，按照醫生的建議規範、足療程地使用藥物，同時注意休息、多喝水、保持室內空氣流通等，身體的免疫力能夠逐漸恢復正常，支原體感染引起的咳嗽就能得到有效控制並最終治癒。例如一些免疫力正常的成年人，在感染支原體後，經過2到3周的規範治療，咳嗽症狀基本可以完全消失。
不過，也有一些特殊情況可能會影響治癒的進程。比如患者本身免疫力低下，像患有免疫缺陷疾病、長期使用免疫抑制劑等，身體難以有效清除支原體，咳嗽症狀可能會持續較長時間，治療難度也會相應增加。
患病後應盡早治療，嚴格遵醫囑用藥，避免自行停藥或換藥，同時加強自身營養，適當鍛鍊，以增強免疫力，促進康復。
