一般情況下，流感病毒檢測不能檢測出新冠。
流感病毒檢測主要是針對流感病毒特定的抗原、核酸等進行檢測。其原理是利用能夠識別流感病毒特徵結構或遺傳物質的試劑，通過特定的技術手段，如免疫螢光法、核酸擴增法等，來判斷樣本中是否存在流感病毒。而新冠病毒有與流感病毒完全不同的生物學特徵，包括病毒的形態結構、基因序列等。檢測新冠病毒需要專門針對新冠病毒的特異性檢測方法，例如新冠核酸檢測是檢測新冠病毒獨特的核酸序列，抗原檢測則是檢測新冠病毒表面特定的抗原蛋白。
由於流感病毒和新冠病毒在生物學特性上差異明顯，用於檢測流感病毒的試劑和方法無法對新冠病毒的特徵物質進行有效識別和檢測。所以，依靠流感病毒檢測手段通常難以發現新冠病毒的存在。
在進行病毒檢測時，若懷疑感染新冠，應選擇專門的新冠檢測方式。若出現發熱、咳嗽等呼吸道症狀，不要自行判斷，應及時前往醫療機構，由專業人員根據具體情況安排合適的檢測項目，以明確病因，進而採取針對性的治療措施。
