一般情況下，肛乳頭瘤手術後恢復時間在2-4周。
肛乳頭瘤手術後的恢復時間受多種因素影響。手術方式是重要因素之一，傳統的手術切除創面相對較大，恢復時間可能會接近4周；而採用吻合器等微創手術方式，對組織的損傷較小，恢復相對較快，通常2周左右能基本恢復。患者自身的身體狀況也會影響恢復時間，年輕、體質較好的患者恢復能力強，恢復時間可能更短；而老年患者或有基礎疾病的患者，恢復時間可能會稍長。
術後的護理和是否出現併發症也與恢復時間密切相關。如果術後嚴格按照醫囑進行護理，保持肛周清潔，避免感染，飲食上注意多吃蔬菜、水果，保持大便通暢，恢復會比較順利。但如果出現出血、感染等併發症，恢復時間則會相應延長。
術後要保持肛周清潔乾燥，每次排便後可用溫水清洗。避免久坐、久站，適當進行提肛運動，促進局部血液循環。飲食宜清淡，避免辛辣刺激性食物，以防刺激傷口。同時，要密切觀察傷口恢復情況，若出現疼痛加劇、出血等異常，應及時就醫。
