一般情況下，肛瘻術後疼痛3-10天能好。
肛瘻手術會對肛門周圍組織造成一定損傷，術後疼痛時間受多種因素影響。若肛瘻病情較輕，手術創面較小，患者自身恢復能力較強，且術後護理得當，疼痛通常會在3-5天逐漸減輕並好轉。而對於病情較重、手術創面較大的患者，疼痛可能會持續5-10天。因為創面大，恢復相對較慢，神經末梢受刺激的時間也會更長。
術後疼痛的緩解還與手術方式有關。傳統的肛瘻切開術創面相對開放，疼痛時間可能稍長；而一些採用微創技術的手術，對組織損傷較小，疼痛持續時間可能會短一些。同時，患者的疼痛感受也存在個體差異，對疼痛敏感的患者可能感覺疼痛時間更長。
術後要保持肛門清潔，每次排便後用溫水清洗，避免糞便殘留刺激創面。飲食宜清淡，多吃蔬菜、水果，保持大便通暢，防止便秘或腹瀉加重疼痛。避免久坐久站，適當活動促進血液循環，利於創面恢復。若疼痛持續加重或伴有發熱等異常，應及時就醫。
