頭疼三天一次有可能是高血壓、神經性頭疼、偏頭痛等原因引起， 可以通過藥物治療以及針灸治療等方式進行治療。
1.高血壓：在生活中如果經常生氣著急、身體過於肥胖，還有長時間精神緊張時，都有可能會誘發高血壓，從而引起頭疼，另外還伴有渾身乏力，心悸耳鳴等不適的症狀，如果血壓控制不大，有可能會頭疼三天一次。可以配合醫生的指導使用高血壓類的藥物治療，常用藥物有纈沙坦片、厄貝沙坦氫氯噻嗪片等。
2.神經性頭疼：生活中如果經常焦慮、抑鬱或者是過度熬夜時，都有可能會導致精神壓力過大，引起神經性頭疼，如果長時間得不到改善，會出現頭痛三天發作一次，另外還會伴有記憶力減退。可以採用電針療法、電刺激療法等理療方法來改善，另外還要使用營養神經類的藥物治療，比如谷維素片、甲鈷胺片。
3.偏頭痛：如果內分泌代謝紊亂或者是受到環境因素影響時，都有可能會誘發偏頭痛，會出現頭部偏側部位疼痛，容易出現三天發作一次。通常需要遵醫囑使用非甾體抗炎藥物進行治療，常用藥物有布洛芬緩釋膠囊、雙氯芬酸鈉緩釋片等。
另外腦血管疾病也有可能會誘發頭痛三天發作一次。可以去正規醫院通過頭顱部位的核磁共振以及頭部CT等方式，對腦部進行全面的檢查，查明具體病因後再對症治療，建議在患病期間應保持良好的情緒狀態，避免情緒過於激動。
