由於脊髓空洞症是一種病變範圍比較廣的高發疾病，最佳治療時間是越早越好，只有早期干預，及時進行治療才是患者得到最佳治療時間。而治療方法分為，手術治療、乾細胞移植治療、藥物治療、針灸治療、物理治療等等方法。
1.手術治療：做手術的目的是為排除空洞的液體，減低脊髓內壓，解除小腦扁桃體、延髓、脊髓的骨性壓迫。手術方法有脊髓空洞蛛網膜下隙分流術，使空洞與蛛網膜下腔相通，達到分流的目的；
2.乾細胞移植治療：乾細胞移植技術廣泛的臨床應用，乾細胞移植後分化成神經細胞，可以促進神經細胞再生，乾細胞浸入損傷部位並對壞死組織發揮吞噬作用修復病變組織，促進局部新生血管生成和血管重建，改善神經營養，恢復正常的神經組織，改善功能；
3.藥物治療：可以使用維生素B族、血管擴張劑、神經細胞代謝功能活化劑等，均可應用；
4.針灸治療：體針取穴，主穴：華佗突脊，病變相應節段人配穴，肩髓、曲池、秩邊；
5.物理治療：運動是物理治療的核心，通過主動或者被動的方式改善局部或者整體的功能提高身體素質，可以進行肌力訓練、步態訓練、有氧訓練、平衡訓練等等。
