肛瘻肛周膿腫的治療方法有藥物治療、手術治療、中醫治療等。
1. 藥物治療：適用於症狀較輕或膿腫初期，主要採用抗生素類藥物，如頭孢菌素、甲硝唑等，通過抑制或殺滅細菌，控制感染擴散，緩解炎症症狀。同時可配合外用藥物，如金黃膏、魚石脂軟膏等，塗抹於肛周，起到消腫止痛、清熱解毒的作用。
2. 手術治療：是主要的治療方式。切開引流術，能及時排出膿腫內的膿液，減輕局部壓力，緩解疼痛，防止感染進一步蔓延。肛瘻切開術或切除術，針對肛瘻形成後的情況，直接切除瘻管組織，達到根治目的。掛線療法常用於高位肛瘻，利用橡皮筋或藥線的慢性切割作用，避免一次性切斷括約肌導致肛門失禁。
3. 中醫治療：中醫可通過內服中藥，依據患者具體症狀、體徵進行辨證論治，以清熱利濕、解毒排膿等為原則，調整機體陰陽平衡，增強抵抗力。還可採用中藥坐浴，如苦參湯等，通過溫熱藥液的作用，促進局部血液循環，減輕炎症反應，緩解疼痛。
治療後要保持肛周清潔，排便後用溫水清洗，避免局部摩擦。飲食上，避免食用辛辣、油膩等刺激性食物，多吃富含膳食纖維的食物，保持大便通暢。同時，要注意休息，避免久坐、久站，適當進行體育鍛鍊，增強體質，促進恢復。嚴格按照醫生囑咐定期換藥、復查，以便及時發現並處理可能出現的問題 。
