基孔肯雅熱合併心肌炎的治療方法主要有一般治療、藥物治療、免疫治療、對症治療、手術治療等。
1. 一般治療：基孔肯雅熱合併心肌炎時，患者需臥床休息，減少體力消耗，降低心臟負擔。因為活動會增加心臟做功，患病時心臟功能受損，休息有助於心臟恢復。同時要保證充足營養攝入，多食用富含維生素、蛋白質的食物，如新鮮蔬果、瘦肉等，為身體提供能量和修復所需物質，促進心肌細胞修復，利於病情好轉。
2. 藥物治療：遵醫囑使用利巴韋林顆粒、阿昔洛韋片、更昔洛韋膠囊，這些抗病毒藥物可抑制基孔肯雅熱病毒複製，減輕病毒對心肌的進一步損傷。病毒感染是引發疾病的重要因素，控制病毒能從根源上緩解病情。同時，遵醫囑使用輔酶Q10膠囊、維生素C片、肌苷片等營養心肌藥物，可改善心肌代謝，增強心肌能量供應，促進心肌細胞修復和再生。
3. 免疫治療：對於病情嚴重、自身免疫系統過度激活的基孔肯雅熱合併心肌炎患者，可遵醫囑使用免疫抑制劑，如環孢素軟膠囊、他克莫司膠囊、硫唑嘌呤片。免疫抑制劑能調節異常的免疫反應，避免免疫系統對心肌組織的過度攻擊，減輕心肌炎症損傷，有助於穩定病情，促進心肌功能恢復。
4. 對症治療：針對基孔肯雅熱合併心肌炎引發的症狀進行處理。若出現心律失常，可遵醫囑使用抗心律失常藥物如胺碘酮片、普羅帕酮片、美托洛爾緩釋片來糾正心律；若有心力衰竭，使用利尿劑如呋塞米片、螺內酯片、氫氯噻嗪片減輕心臟負荷，改善心臟功能，緩解不適症狀，提高患者生活質量。
5. 手術治療：在少數病情極為嚴重，如出現嚴重的心肌病變、心臟結構功能嚴重受損，且藥物等保守治療無效時，可考慮心臟移植手術。通過移植健康心臟，替換受損心臟，從根本上解決心臟功能嚴重障礙問題，為患者帶來生存希望，但手術風險高，需嚴格評估和謹慎操作。
患者在治療期間要保持良好生活習慣，保證充足睡眠，避免熬夜和劇烈運動。飲食上遵循清淡、易消化原則，避免食用辛辣、油膩、刺激性食物。嚴格按照醫生囑咐按時服藥，定期復查，以便及時瞭解病情變化和調整治療方案。
