輕微腦炎一般不一定會留下後遺症。這取決於多種因素，如腦炎的類型、治療是否及時有效、個體的身體狀況等。有些輕微腦炎患者經積極治療後能完全康復，不遺留任何問題；但也有部分患者可能出現一些後遺症。
輕微腦炎是因病毒、細菌等病原體侵犯腦實質引發的炎症。病情輕微意味著炎症範圍局限、症狀相對不嚴重。若能在早期及時診斷並採用針對性治療，比如合理使用抗病毒或抗菌藥物，同時配合營養神經等支持治療，多數患者可恢復正常。
即便病情輕微，若治療不及時，炎症可能對腦組織造成一定損傷。比如影響神經功能，導致記憶力減退、注意力不集中等認知功能障礙；或者影響運動神經，出現肢體運動不協調等情況。而且個體差異也會影響恢復情況，體質較弱者恢復相對困難，遺留後遺症的可能性增加。
在日常生活中，對於曾患輕微腦炎的人，要注意休息，保證充足睡眠，讓大腦得到充分恢復。飲食上，多攝入富含營養的食物，如新鮮蔬果、優質蛋白等，增強身體抵抗力。同時，要按照醫生的囑咐定期復查，以便及時發現可能出現的問題並進行處理。
