一般來說，兒童益生菌在飯後 20 分鐘至 1 小時內服用較好。
兒童的腸道功能相對較弱，益生菌可以幫助調節腸道菌群平衡。在飯後 20 分鐘至 1 小時內，胃酸的分泌相對較少，此時服用益生菌，能夠減少胃酸對益生菌活性的影響，使其更容易在腸道中定植併發揮作用。
具體而言，兒童在進食後，胃內的食物會中和一部分胃酸，使得胃內的酸性環境有所減弱。這個時候服用益生菌，益生菌可以更好地通過胃部進入腸道。如果在飯前服用，胃酸的濃度較高，可能會對益生菌的活性產生一定的抑製作用，影響其效果。而如果在飯後過長時間服用，食物已經從胃中排空進入腸道，此時胃酸又會開始分泌，同樣可能對益生菌的活性產生不利影響。
每個孩子的身體狀況和腸道問題都有所不同，因此在給孩子服用益生菌時，最好根據孩子的具體情況，在醫生的指導下進行。同時，家長還應注意孩子的飲食均衡，多給孩子吃一些富含膳食纖維的食物，以促進腸道蠕動，維持腸道健康。
