腳趾甲有橫紋凹凸不平可能是營養不良、真菌感染、外傷、甲溝炎、先天性因素等，需要針對病因治療，可採取的方法有補充營養、抗真菌治療、處理傷口、消炎治療等。
1.營養不良：長期飲食不均衡，導致體內缺乏維生素、礦物質等營養素，可能會影響指甲的正常生長，出現橫紋凹凸不平。可通過調整飲食來改善，多吃富含蛋白質、維生素A、B、C、D及鈣、鐵、鋅等食物，如牛奶、雞蛋、胡蘿蔔、蘋果、香蕉、魚肉、菠菜等。遵醫囑用藥，如多維元素片、碳酸鈣D3片、葡萄糖酸鋅膠囊。
2.真菌感染：當腳趾甲受到真菌感染時，如灰指甲，會導致指甲增厚、變色、變形，出現橫紋凹凸不平。可外用抗真菌藥物治療，如阿莫羅芬搽劑、酮康唑乳膏、特比萘芬乳膏等。如果病情嚴重，還需口服抗真菌藥物，如伊曲康唑膠囊、氟康唑膠囊、鹽酸特比萘芬片等，但口服藥物需在醫生的指導下使用，且注意監測肝功能。
3.外傷：腳趾甲受到擠壓、碰撞等外傷後，可能會導致指甲受損，出現橫紋凹凸不平。如果外傷較輕，一般不需要特殊處理，隨著指甲的生長，受損的部分會逐漸被剪掉。如果外傷較重，出現指甲脫落、出血等情況，應及時就醫，進行清創、包扎等處理。
4.甲溝炎：甲溝炎是指甲周圍組織的炎症，可由細菌感染引起。炎症會影響指甲的生長，導致指甲出現橫紋凹凸不平。治療甲溝炎需要保持局部清潔，可外用碘伏消毒，塗抹莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏等抗生素藥膏。如果有膿腫形成，可能需要切開引流。
5.先天性因素：有些人天生指甲就比較脆弱，容易出現橫紋凹凸不平的情況。這種情況一般不需要特殊治療，平時注意保護指甲，避免過度修剪、磨損等。
在日常生活中，要注意保持腳部的清潔乾燥，避免穿過緊的鞋子，減少對腳趾甲的擠壓和摩擦。如果腳趾甲的橫紋凹凸不平症狀持續不緩解或加重，應及時就醫，明確病因，進行針對性治療。
