男士泌尿感染可選擇的藥物有抗生素類如左氧氟沙星、頭孢克肟、阿奇霉素，中成藥物如三金片，抗真菌藥物如氟康唑等。
1. 左氧氟沙星：屬於喹諾酮類抗生素，對常見的革蘭陰性菌和革蘭陽性菌都有較好的抗菌活性。能抑制細菌DNA旋轉酶的活性，阻礙細菌DNA複製，從而達到殺菌的效果。常用於治療由大腸埃希菌、克雷伯菌屬等引起的泌尿系統感染，口服吸收良好，在尿液中能達到較高濃度，發揮有效的抗菌作用。
2. 頭孢克肟：是第三代頭孢菌素類抗生素，對革蘭陰性菌有較強的抗菌作用，對β-內酰胺酶高度穩定。通過抑制細菌細胞壁的合成來發揮殺菌功效，可用於治療多種敏感菌導致的泌尿感染，不良反應相對較少，安全性較高。
3. 阿奇霉素：屬於大環內酯類抗生素，對衣原體、支原體等非典型病原體有良好的抗菌活性。能與細菌核糖體的50S亞基結合，抑制細菌蛋白質合成。對於由衣原體、支原體感染引起的泌尿生殖系統炎症有較好療效，服用方便，一般每日只需服用一次。
4. 三金片：是一種中成藥，主要成分有金櫻根、菝葜、羊開口、金沙藤、積雪草等。具有清熱解毒、利濕通淋、益腎的功效。可緩解泌尿感染導致的小便短赤、淋瀝澀痛等症狀，常與抗生素聯合使用，能增強治療效果，且副作用相對較小。
5. 氟康唑：是一種抗真菌藥物，主要用於治療由真菌感染引起的泌尿系統疾病。能抑制真菌細胞膜上麥角固醇的生物合成，影響細胞膜的通透性，從而抑制真菌生長。當男士泌尿感染是由白色念珠菌等真菌感染所致時，氟康唑可發揮有效的治療作用。
在用藥治療男士泌尿感染時，要嚴格按照醫生的囑咐按時按量服藥，不能自行增減藥量或停藥。治療期間要多喝水，增加排尿量，通過尿液衝刷尿道，有助於減輕炎症。同時要注意個人衛生，保持會陰部清潔，避免性生活，防止交叉感染。飲食上盡量避免食用辛辣、刺激性食物，以免加重症狀。
