早上起床眼睛疼流眼淚可能由多種原因引起，如眼部感染、過敏、乾眼症、倒睫、眼疲勞等。
眼部感染：細菌、病毒等感染眼部，可導致眼睛紅腫、疼痛、流淚。需使用抗生素或抗病毒眼藥水治療，如左氧氟沙星滴眼液、阿昔洛韋滴眼液等。
過敏：接觸過敏原如花粉、灰塵等，引起眼部過敏反應，出現眼睛癢、流淚等症狀。可使用抗過敏眼藥水，如色甘酸鈉滴眼液，同時避免接觸過敏原。
乾眼症：淚液分泌不足或蒸發過多，導致眼睛乾澀、疼痛、流淚。可使用人工淚液，如玻璃酸鈉滴眼液，注意保持眼部濕潤，避免長時間用眼。
倒睫：睫毛倒向眼球，刺激角膜，引起眼睛疼痛、流淚。需由醫生進行手術矯正。
眼疲勞：長時間用眼、過度疲勞，可導致眼睛疼痛、流淚。應注意休息，多做眼保健操，緩解眼疲勞。
注意事項：如果眼睛疼痛、流淚持續不緩解或伴有其他症狀，如視力下降、頭痛等，應及時就醫，進行詳細檢查和診斷，以明確病因並採取相應的治療措施。
