小腎結石可通過大量飲水、藥物治療、運動排石、體外衝擊波碎石、手術治療等方法處理。
1. 大量飲水：對於小腎結石患者，大量飲水能增加尿量，尿液增多後可對尿路起到衝刷作用，促使小的結石隨著尿液排出體外。建議每天飲水量在 2000 - 3000 毫升，可分多次飲用，不要一次性大量飲水，保持尿液顏色清淡為宜。通過持續的尿液衝刷，能有效減少結石在體內停留的時間，降低結石進一步增大或引發梗阻的風險。
2. 藥物治療：可使用排石顆粒、腎石通片、金錢草膠囊等藥物。排石顆粒能清熱利水、通淋排石，有助於促進輸尿管蠕動，使結石更容易排出；腎石通片能活血止痛、化石排石，改善結石引發的局部血液循環，利於結石鬆動排出；金錢草膠囊有清熱利濕、通淋消腫的功效，可緩解結石導致的泌尿系統炎症，輔助結石排出，具體用法用量需嚴格遵醫囑。
3. 運動排石：小腎結石患者適當運動，如跳繩、跑步、爬樓梯等，能利用身體的震動和重力作用，幫助結石在體內移動，增加結石排出的幾率。跳繩時身體上下跳動，結石會在泌尿系統內受到震動，更容易脫離原來的位置；跑步和爬樓梯過程中，身體的運動也能促使結石向尿道方向移動，最終隨尿液排出體外。
4. 體外衝擊波碎石：利用高能衝擊波聚焦後作用於小腎結石，將結石粉碎成細小的顆粒。這些小顆粒更容易通過尿液排出體外。體外衝擊波碎石無需開刀，對身體的創傷較小。它通過精確的定位系統，能準確地將衝擊波聚焦在結石上，在不損傷周圍正常組織的情況下，將結石擊碎，從而達到治療小腎結石的目的。
5. 手術治療：當其他方法效果不佳時可考慮。如輸尿管鏡碎石取石術，通過輸尿管鏡進入泌尿系統，直接找到結石並將其擊碎取出。這種方法能直接處理結石，療效確切。還有經皮腎鏡碎石取石術，適用於一些位置較特殊的小腎結石，通過在腰部建立通道進入腎臟，將結石取出。手術治療能快速有效地解決小腎結石問題，但相對風險也較高。
治療期間要按照醫生的囑咐進行各項操作，包括按時服藥、定期復查等。日常飲食要注意避免高草酸、高鈣食物，如菠菜、巧克力等。保持規律作息，避免熬夜，適當增加活動量，促進身體新陳代謝，以利於病情恢復。
