男性菜花狀疣可能是性接觸傳播、間接接觸傳播、自身免疫力低下、外傷感染、病毒潛伏感染等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有藥物治療、物理治療、手術治療等。
1. 性接觸傳播：與患有菜花狀疣的患者發生性行為，病毒易通過皮膚黏膜微小破損處進入人體並感染。可使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊、氟尿嘧啶軟膏，需遵醫囑用藥。通過塗抹藥物，抑制病毒複製，促使疣體壞死、脫落。
2. 間接接觸傳播：使用被病毒污染的毛巾、浴巾、馬桶座圈等物品，可能感染病毒引發菜花狀疣。可採用激光治療，利用高溫將疣體碳化去除；也可用冷凍治療，通過低溫使疣體組織壞死脫落；還能進行電灼治療，以高頻電流破壞疣體。
3. 自身免疫力低下：長期熬夜、過度勞累、營養不良等導致身體免疫力下降，易受到病毒侵襲引發菜花狀疣。可口服轉移因子膠囊、胸腺肽腸溶片、匹多莫德顆粒，遵醫囑用藥，增強機體免疫力，輔助清除病毒。
4. 外傷感染：皮膚出現傷口時，人乳頭瘤病毒可經傷口侵入人體並在局部繁殖形成疣體。較小疣體可外用重組人干擾素α2b凝膠、酞丁安乳膏、維A酸乳膏，遵醫囑使用，促進疣體消退。較大疣體可考慮手術切除。
5. 病毒潛伏感染：曾感染過人乳頭瘤病毒，病毒潛伏在體內，在某些誘因下可引發菜花狀疣。可進行光動力治療，先塗抹光敏劑，再用特定波長光照射，破壞疣體組織；也可採用溫熱療法，利用物理溫熱效應抑制病毒複製；還可嘗試免疫療法，注射卡介菌多糖核酸注射液等，遵醫囑進行。
治療期間要保持患處清潔乾燥，避免搔抓以防感染。治療後定期復查，觀察是否復發。同時，要養成良好生活習慣，均衡飲食、適度鍛鍊、規律作息，提高身體免疫力，降低復發風險。
