肺支原體衣原體陽性可能是密切接觸感染源、自身免疫力低下、環境因素、呼吸道黏膜防禦功能受損、既往肺部疾病等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有隔離休息、增強免疫力、改善環境、修復呼吸道功能、治療基礎疾病等。
1. 密切接觸感染源：與攜帶支原體衣原體的患者密切接觸，如共用餐具、咳嗽飛沫傳播等，易被感染。可使用阿奇霉素顆粒，按醫囑根據體重服用；羅紅霉素片，遵醫囑每日服用劑量；克拉霉素膠囊，嚴格遵循醫囑用藥。同時要做好隔離，避免交叉感染，盡量不前往人員密集場所。
2. 自身免疫力低下：過度勞累、長期熬夜、營養不良等導致身體免疫力降低，易受支原體衣原體侵襲。要保證充足睡眠，合理膳食，多攝入富含蛋白質和維生素的食物。可在醫生指導下使用轉移因子口服液、匹多莫德顆粒、脾氨肽口服凍乾粉來增強免疫力。
3. 環境因素：長期處於通風不良、潮濕的環境，利於支原體衣原體滋生繁殖。需保持居住環境通風良好、乾燥清潔，定期打掃房間。必要時可使用空氣淨化器改善空氣質量。
4. 呼吸道黏膜防禦功能受損：如經常吸煙、吸入刺激性氣體等，破壞呼吸道黏膜屏障。應戒煙，避免接觸刺激性物質。可在醫生指導下使用氨溴索口服液、桉檸蒎腸溶軟膠囊、乙酰半胱氨酸泡騰片促進呼吸道黏膜修復。
5. 既往肺部疾病：原有慢性支氣管炎、支氣管哮喘等肺部疾病，使呼吸道抵抗力下降。積極治療基礎疾病，如慢性支氣管炎可使用氨茶鹼片、沙丁胺醇氣霧劑、異丙托溴銨氣霧劑；支氣管哮喘可使用布地奈德福莫特羅粉吸入劑、沙美特羅替卡松粉吸入劑、孟魯司特鈉片，均需遵醫囑。
治療期間要注意休息，避免劇烈運動，飲食清淡易消化，多喝溫水，促進新陳代謝，利於身體恢復。按要求定期復查，以便醫生瞭解治療效果及時調整治療方案 。
