在平時生活中，大部分的人認為腦膜炎與流腦是一種完全相同的疾病，只是稱呼不相同，但事實上腦膜炎與流腦是兩種完全不同的疾病。比如那雙方的受感染部位為例——腦膜炎指的是是腦膜或腦脊膜（就是頭骨與大腦之間的一層膜）被感染的疾病，通常會有細菌或病毒感染身體任何一部分的併發症，比如耳部或上呼吸道感染等等。總而言之，概括性的來說——腦膜炎就是因為病原體所引發的疾病。但是流腦是因為腦膜炎雙球菌引起的化膿性腦膜炎，比方說致病菌是由鼻咽部侵入血循環，形成敗血症，最後局限於腦膜及脊髓膜，形成化膿性腦脊髓膜病變。此外，二者的不同還表現在以下幾個方面：
1.臨床表現完全不同：腦膜炎——早期表現為患者精神狀態改變，如煩躁好哭；精神呆滯；不喜歡遊戲；並且伴有低熱、食慾減退、嘔吐、睡眠不安、消瘦的現象，在後期表現為頭痛的時間加長，嘔吐現象的嚴重，並且逐步出現嗜睡的現象。
流腦——低熱、輕微頭痛及咽痛等上呼吸道症狀，皮膚可有少數細小出血點，病情嚴重者伴有劇烈頭痛、頻繁嘔吐、狂躁以及腦膜刺激症狀，血壓可升高而脈搏減慢的病症。
2.流行時期完全不同：流腦的主要流行時期是在冬末——春初，而腦膜炎的主要流行季節在於夏季和秋季
3.治療方式的不同：流腦可用抗生素（如青霉素）控制感染，但腦膜炎是屬於病毒感染，至今尚無特殊治療沒有有效的治療方法，所以兒童要從小接種疫苗，並且防蚊、滅蚊尤為重要，這是腦膜炎的主要傳播途徑之一。
4.傳播途徑完全不同：流腦通過空氣或者是人的呼吸道傳播，而腦膜炎主要是通過帶有乙型腦炎病毒的蚊蟲叮咬傳播
5.檢測結果不同：醫學上表明兩者的腦脊液化驗結果也有很多不同，流腦在腦脊液塗片或培養時可發現腦膜炎雙球菌，腦脊液渾濁如米湯樣，白細胞數和蛋白質明顯增高，而糖和氯化物減少，乙腦的腦脊液呈澄清或微混，白細胞數和蛋白質僅輕度增高，糖和氯化物一般正常。
總而言之，若有發現病患有上述現象，應及時前往醫院就診，日常生活中保持健康的生活作息，經常鍛鍊身體增強身體素質，養成良好的生活作息習慣。並且，對於兒童來說要及時接受相關疫苗的注射。
