通常情況下，流感病毒感染期間不建議打流感疫苗。
因為當人體正遭受流感病毒感染時，免疫系統已經在全力應對當前入侵的病毒。此時接種流感疫苗，疫苗作為一種外來的抗原物質，可能會加重免疫系統的負擔，干擾免疫系統對正在感染的流感病毒的正常防禦反應，不利於身體對現有感染的恢復。而且在感染期間接種疫苗，身體可能無法產生良好的免疫應答，從而影響疫苗的接種效果，無法有效發揮預防後續流感病毒感染的作用。
流感疫苗的作用機制是通過將經過處理的流感病毒相關抗原注入人體，刺激免疫系統產生針對特定流感病毒的抗體。在身體處於健康狀態時接種，免疫系統能夠有條不紊地對疫苗抗原進行識別、應答並產生記憶細胞，當真正的流感病毒入侵時，這些記憶細胞就能快速啓動免疫反應，有效抵御病毒。但在感染期間，免疫系統的正常工作秩序已被打亂，難以按照正常模式對疫苗做出有效反應。
在身體感染流感病毒後，應先積極治療感染，待身體完全恢復，症狀消失，體力和免疫力基本恢復正常後，再考慮接種流感疫苗。這樣既能保證身體有足夠的能力應對疫苗帶來的刺激，產生良好的免疫效果，又能避免因接種疫苗給身體帶來不必要的負擔，確保疫苗發揮應有的預防作用。
