一般情況下，外科口罩能在一定程度上防流感病毒。
外科口罩通常由三層結構組成，外層為防水層，可防止飛沫濺入；中層為過濾層，能有效過濾空氣中的顆粒物質；內層為親膚層，接觸面部較為舒適。流感病毒主要通過飛沫傳播，當患者咳嗽、打噴嚏或說話時，會噴出攜帶病毒的飛沫。外科口罩的過濾層能夠阻擋大部分較大的飛沫，從而減少健康人吸入流感病毒的幾率。
而且，外科口罩與面部貼合較好，能在口鼻周圍形成相對封閉的空間，進一步降低病毒從側面進入的可能性。不過，外科口罩對流感病毒的防護效果並非絕對。如果口罩佩戴不正確，比如沒有完全遮住口鼻、口罩邊緣有縫隙等，防護能力就會大打折扣。同時，流感病毒可能存在變異，對於一些特殊變異的流感病毒，外科口罩的防護效果可能會受到影響。
在流感高發季節，佩戴外科口罩時要確保口罩貼合面部，遮住口鼻。要及時更換口罩，一般4小時左右更換一次，若口罩被污染或潮濕應立即更換。保持良好的個人衛生習慣也很重要，勤洗手、避免前往人員密集場所等，多方面結合才能更好地預防流感病毒。
