幽門螺旋桿菌的指標主要有尿素呼氣試驗、血清學檢測、胃鏡檢查及病理活檢等。
1. 尿素呼氣試驗：
這是臨床上最常用的檢測方法之一，具有無痛、無創、方便等優點。幽門螺旋桿菌能夠產生尿素酶，該酶可分解尿素，患者口服含有被標記過的尿素的試劑後，通過檢測呼出氣體中尿素的分解產物來判斷是否感染幽門螺旋桿菌。一般分為碳-13和碳-14兩種標記方法，碳-13對人體無放射性，適合孕婦、兒童等特殊人群；碳-14有一定放射性，但輻射量極小，檢測靈敏度較高。
2. 血清學檢測：
通過檢測血液中幽門螺旋桿菌抗體來判斷是否感染過幽門螺旋桿菌。此方法操作簡便，但不能區分是現在感染還是既往感染，因為即使幽門螺旋桿菌已被清除，抗體在體內仍可能存在一段時間。常用於流行病學調查等。
3. 胃鏡檢查及病理活檢：
在做胃鏡時，可取胃黏膜組織進行病理檢查，直接觀察幽門螺旋桿菌的形態，同時還能瞭解胃部的病變情況。這是診斷幽門螺旋桿菌感染的金標準，但胃鏡檢查屬於侵入性檢查，可能給患者帶來一些不適，一般在有其他胃部疾病需要做胃鏡時順便進行幽門螺旋桿菌檢測。
幽門螺旋桿菌檢測結果受多種因素影響，如近期使用抗生素、鉍劑、質子泵抑制劑等藥物可能導致檢測結果假陰性。若懷疑感染幽門螺旋桿菌，應在停藥一段時間後再進行檢測，具體情況需結合醫生的專業判斷來確定後續診療方案。
