通常可以通過多種方法檢測出呼吸道合胞病毒，常見的如核酸檢測、抗原檢測、血清學檢測等。一般核酸檢測的靈敏度較高，檢測結果的病毒載量數值大於等於1000拷貝/毫升時，可提示感染；抗原檢測一般呈陽性則提示感染；血清學檢測中，特異性抗體IgM陽性或恢復期血清特異性抗體IgG較急性期有4倍及以上升高可診斷。
核酸檢測的原理是通過提取呼吸道標本中的病毒核酸，利用聚合酶鏈反應PCR等技術進行擴增，檢測是否存在呼吸道合胞病毒的特定核酸序列。抗原檢測是利用抗原抗體特異性結合的原理，檢測呼吸道標本中是否存在病毒抗原。血清學檢測則是檢測人體血液中針對病毒產生的抗體。
在臨床實際應用中，核酸檢測能早期、快速、準確地檢測出病毒，適用於疾病早期診斷；抗原檢測操作簡便、快速，但靈敏度相對核酸檢測略低；血清學檢測主要用於回顧性診斷和流行病學調查。
在檢測前應避免進食過飽，保持口腔清潔。檢測後要注意休息，避免劇烈運動。若檢測結果異常，應及時就醫，按照醫生的建議進行進一步檢查和治療，同時注意個人衛生，勤洗手，避免前往人員密集場所，防止病毒傳播。
