通常情況下，胎兒消化道畸形四維超聲是可以查出來的。
四維超聲即實時三維超聲，它是在二維超聲的基礎上，通過計算機軟件的處理和轉換，能夠實時地獲取胎兒的立體圖像。其原理是利用超聲波的反射和折射，對胎兒的結構進行多方位、多角度的觀察。對於胎兒消化道畸形的檢測，四維超聲有重要的作用。比如食管閉鎖及食管氣管瘻，四維超聲可以觀察到胎兒胃泡是否存在以及大小是否正常，如果胃泡不顯示或者明顯小於孕周，就可能提示存在食管閉鎖等畸形。再如先天性肥厚性幽門狹窄，通過四維超聲可以清晰地看到幽門肌層的厚度及長度變化，若幽門肌層增厚、幽門管腔變窄，就有助於診斷該疾病。還有腸道閉鎖或狹窄，當腸道某段出現閉鎖或狹窄時，胎兒腸道的連續性會中斷或者局部腸管擴張，四維超聲能夠發現這些異常表現。
也存在一些局限性。比如胎兒的體位不佳，某些部位被遮擋，可能會影響超聲的觀察效果。另外，一些微小的消化道畸形，可能由於分辨率的限制而難以被準確發現。
孕婦在進行四維超聲檢查時，要提前適當活動，促使胎兒改變體位，以便醫生能更好地觀察胎兒的各個部位。檢查時間也很關鍵，一般在孕22 - 26周進行，此時胎兒的結構已經基本形成，羊水相對充足，胎兒活動空間較大，有利於超聲檢查。
