一般情況下，巴氏腺囊腫不會自己消。
巴氏腺囊腫是因前庭大腺管開口部阻塞，分泌物積聚於腺腔而形成。前庭大腺位於兩側大陰唇後部，腺管開口於小陰唇內側靠近處女膜處，在正常情況下，前庭大腺會分泌黏液，起到潤滑陰道的作用。當腺管因各種原因，如先天性腺管狹窄、腺腔內黏液濃稠或因慢性炎症、損傷等導致腺管堵塞後，分泌物就無法正常排出，從而積聚形成囊腫。由於囊腫的形成是因為腺管的阻塞問題沒有得到解決，積聚的分泌物會持續存在，所以通常不會自行消失。
如果囊腫較小且沒有感染，患者可能沒有明顯的症狀，對日常生活影響不大。但如果囊腫較大，患者可能會感到外陰墜脹感或性交不適等。而當囊腫繼發感染時，就會形成巴氏腺膿腫，出現局部紅腫、疼痛劇烈等症狀，給患者帶來更大的痛苦。
對於巴氏腺囊腫，不能寄希望於它自行消失。如果囊腫較小且無症狀，可定期觀察；若囊腫較大或出現症狀，往往需要採取相應的治療措施，如藥物治療、手術治療等。平時要注意保持外陰清潔，避免穿過緊的衣物，減少對外陰的摩擦和刺激。性生活也要注意衛生，防止局部感染。
