一般來說，肛瘻通常需要通過手術來治療。
肛瘻是肛門直腸周圍膿腫破潰或切開引流後的後遺病變，主要由內口、瘻管、外口三部分組成。由於肛瘻的內口通常位於肛竇等特殊解剖部位，腸腔內容物可經內口持續進入瘻管，導致瘻管反復感染、化膿，難以自行愈合。手術治療的原理在於準確找到並處理內口，清除感染的瘻管組織，同時盡量減少對肛門括約肌功能的損傷，從而達到根治肛瘻的目的。
在很多情況下，手術是治癒肛瘻的有效方法。對於單純性肛瘻，手術可以直接切除瘻管，促進傷口愈合；對於複雜性肛瘻，通過掛線療法等手術方式，能在緩慢切割瘻管的同時，避免因一次性切斷過多括約肌而導致肛門失禁等嚴重併發症，最大程度保護肛門功能。而且，手術治療相對徹底，能有效降低肛瘻復發的風險，讓患者擺脫肛瘻反復發作帶來的痛苦，提高生活質量。
若不進行手術，僅依靠保守治療，如藥物坐浴、局部換藥等，雖然能在一定程度上緩解肛瘻發作時的症狀，減輕局部炎症反應，但無法從根本上解決內口持續感染的問題，肛瘻容易反復發作，病情可能會逐漸加重，甚至引發更嚴重的併發症。
肛瘻患者應及時就醫，遵循醫生的建議選擇合適的治療方案。治療後要注意保持肛門清潔，養成良好的排便習慣，避免食用辛辣刺激性食物，以促進康復並防止復發。
