肛門流黃水如果比較輕微，一般可以自愈，但是對於比較嚴重的通常不能夠自愈，建議患者及時去醫院肛腸科進行詳細檢查，遵醫囑進行針對性治療。
肛門流黃水如果是局部出現慢性炎症疾病，比如肛周炎症狀比較輕微的，一般情況下能夠自行恢復，但是前提是要保持局部衛生，每次在排便之後要用溫水清洗。如果患者病情比較嚴重，尤其是已經出現了肛周膿腫現象，導致局部化膿產生流黃水，通常情況下不能夠自行恢復，建議患者在醫生指導下使用阿莫西林顆粒、頭孢克肟顆粒、阿莫西林膠囊等藥物進行治療，能夠起到消炎和殺菌作用，嚴重者應該及時去醫院通過穿刺引膿治療。如果治療不及時，很可能會導致局部出現繼發性感染，影響到身體健康。
患者在治療過程當中需要注意個人飲食方面調理，盡量不要吃辣椒、火鍋、燒烤、芥末等過於辛辣及刺激性的食物，否則會對病情恢復造成影響。
