單側腎萎縮可能與先天性發育不全、慢性腎小球腎炎、糖尿病腎病等因素有關。
1.先天性發育不全：如果僅是單側腎萎縮，且自身無其他器質性疾病，考慮與先天性因素有關。在胚胎期一側腎組織和輸尿管胚芽並未正常發育或未發育，出生後即可出現一側腎萎縮、孤立腎等異常發育不全。受生理需要的影響，對側腎臟常會代償性增大。
2.慢性腎小球腎炎：其也被簡稱為慢性腎炎，是一組多病因造成的、以慢性腎小球病變為主的腎小球疾病。其起病隱匿、發展速度緩慢，以血尿、蛋白尿、高血壓、水腫等體徵作為主要臨床表現。該疾病在發展期會造成腎單位受損，當腎小球損傷後，單側腎臟即可出現體積縮小。
3.糖尿病腎病：其是建立在糖尿病基礎上出現的腎損傷，屬於糖尿病併發症的一種。該疾病在病情發展期，可導致腎小動脈硬化、結節性腎小球硬化，並出現腎功能損傷，造成腎臟一側萎縮，嚴重情況下可發展為慢性腎功能衰竭、尿毒症。
還可能與腎結核、高血壓性腎病有關。建議先就醫進行檢查，結合其他體徵、腎功能檢查以及影像學檢查報告進行綜合判斷，明確具體病因後，對症選擇合適的治療方案。相關疾病治療期間，也需加強個人生活護理，遵照醫囑定期復查。
