神經外科和腦外科一般沒有區別，屬於同一個科室。
腦外科和神經外科無論是患者的來源、疾病的治療範圍以及治療的方法基本相同，都是採用科學的方法，以手術以及外科手段等治療為主。通常在治療方面神經包括中杻神經系統和周圍神經系統，中杻神經系統包括了腦和脊髓等，神經外科主要是治療腦、脊髓以及周圍神經等疾病，因此腦外科屬於神經外科，沒有區別。
神經外科可分為急診神經外科、腫瘤神經外科以及功能性神經外科等，急診神經外科主要治療顱腦外傷疾病，如意外的顱腦損傷以及腦出血等。腫瘤神經外科主要是通過手術治療，如垂體瘤、腦膜瘤、神經鞘瘤以及大腦半球腫瘤等顱內和椎管內腫瘤等。功能神經外科主要是治療神經系統功能性疾病，如癲癇、面部痙攣以及肢體無力等。
腦外科是早期醫院對這個科室稱謂，現在大多數醫院稱之為神經外科，而且目前沒有醫院同時設立腦外科和神經外科。
