得了變態性結膜炎的患者，可以口服抗組胺類的藥物緩解發病症狀，配合外用的眼藥水，或者是清熱解毒類的藥物同步治療，效果會更好。另外在藥物治療期間注意不能用手經常揉眼部，也不要使用不乾淨的東西擦拭眼部，避免病菌的二次感染，這樣就能防止病情的不斷發展並加重。
1.口服抗組胺類的藥物
比如說氯雷他定片、息斯敏片或者是苯海拉明片等，都具有抗過敏的功效，適用於各種過敏原刺激所引發的變態性結膜炎，用藥以後眼部瘙癢、流淚、發紅等異常現象就可以得到有效的改善。
2.外用的眼藥水
較為常用的有紅霉素眼膏、諾氟沙星滴眼液、氯霉素滴眼液、利福平眼藥水等，都能夠起到局部殺菌消炎的功效，也是治療變態性結膜炎的常用藥，可以跟口服藥物同時使用，好的會更快。
3.清熱解毒的藥物
如果內熱會使變態性結膜炎患者出現眼部充血嚴重的問題，因此可以服用牛黃解毒片、牛黃清胃丸等藥物進行清熱解毒的治療，改善身體上火的現象，就能促進病情更快更徹底的治癒。
